Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp560Q3URI6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Zfp560Q3URI6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp560Q3URI6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp560Q3URI6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp560Q3URI6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp560Q3URI6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp560Q3URI6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp560Q3URI6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp560Q3URI6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms