Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec31aQ3UPL0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec31aQ3UPL0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec31aQ3UPL0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms