Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc4Q3UP44 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms