Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Skap2Q3UND0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Skap2Q3UND0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms