Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cln5Q3UMW8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cln5Q3UMW8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms