Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrch2Q3UMG5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms