Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cobll1Q3UMF0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms