Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc2Q3ULD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms