Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJC8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJC8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q3UJC8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3UJC8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms