Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Edc4Q3UJB9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms