Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b2Q3UJB0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms