Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm648Q3UJ22 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm648Q3UJ22 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms