Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Greb1Q3UHK3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms