Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll12Q3UDE2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll12Q3UDE2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms