Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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