Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc174Q3U155 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms