Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms