Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pip4p1Q3TWL2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pip4p1Q3TWL2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pip4p1Q3TWL2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pip4p1Q3TWL2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pip4p1Q3TWL2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pip4p1Q3TWL2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pip4p1Q3TWL2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pip4p1Q3TWL2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pip4p1Q3TWL2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms