Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TTL0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TTL0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms