Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q3TTJ4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3TTJ4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms