Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc4Q3TR08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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