Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc102aQ3TMW1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms