Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms