Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uri1Q3TLD5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uri1Q3TLD5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms