Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde12Q3TIU4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde12Q3TIU4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms