Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jmjd8Q3TA59 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Jmjd8Q3TA59 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd8Q3TA59 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd8Q3TA59 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd8Q3TA59 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd8Q3TA59 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd8Q3TA59 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd8Q3TA59 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jmjd8Q3TA59 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms