Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Prr27Q3SYJ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr27Q3SYJ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms