Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms