Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna5Q2MKA5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chrna5Q2MKA5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms