Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm1123Q1RME4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm1123Q1RME4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms