Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne9Q1RLL3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne9Q1RLL3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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