Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myo3bQ1EG27 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo3bQ1EG27 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms