Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ptchd1Q14B62 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ptchd1Q14B62 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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ptchd1Q14B62 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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ptchd1Q14B62 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ptchd1Q14B62 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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ptchd1Q14B62 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms