Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3ip1Q149C2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms