Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms