Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StumQ0VBF8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms