Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms