Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps8Q0P5W1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Vps8Q0P5W1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms