Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssrp1Q08943 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms