Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp2Q08652 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms