Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms