Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HgfQ08048 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms