Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a2Q07643 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms