Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Col17a1Q07563 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms