Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox4Q06831 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms