Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tie1Q06806 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tie1Q06806 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms