Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp2Q06649 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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