Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Larp7Q05CL8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Larp7Q05CL8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms