Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms