Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox12Q04890 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox12Q04890 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms